El Programa de biodiversidad CAF, ejecutado entre 2002 y 2009, se realizó dentro del marco de la estrategia ambiental de CAF y tuvo como objetivo central promover la conservación y el uso sostenible de los ecosistemas, los recursos naturales y genéticos y la biodiversidad. Dentro de sus ámbitos de trabajo, fueron definidas tres líneas de acción, desde las cuales se apoyaron diversos proyectos: a) promoción de iniciativas de conservación de ecosistemas y especies en la región; b) promoción de mecanismos de compensación y/o pago por servicios ambientales (SSAA) para la conservación de los ecosistemas que generan dichos servicios e c) impulso al desarrollo de mercados de la biodiversidad y los recursos genéticos.

Como resultado, este programa de biodiversidad 2002-2009 apoyó a 53 iniciativas en 9 países accionistas. Dicho apoyo fue dirigido a distintos ecosistemas en los países beneficiarios -a través de las líneas de acción concebidas bajo el Programa- cuya área acumulada se calcula en 1.147.177 km². Se estima además que los beneficios potenciales que estas iniciativas han generado o generarán, cubrirán una población de más de 4 millones de personas de manera directa, y 18 millones de personas indirectamente.

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